220004 Molecular biophysics

Details
Department of Natural Sciences
Earliest Possible YearBSc. 2 year
DurationOne block
 
Credits7.5 (ECTS)
Course LevelBSc
 
ExaminationFinal Examination

written examination


Written Exam in Lecturehall

All aids allowed

Description of Examination: 4 timers skriftlig eksamen. Der regnes opgaver bredt inden for kursets emner.

Weight: 100%



pass/fail, internal examiner

Dates of Exam:
28 January 2006
 
Requirement For Attending ExamAflevering af rapport over eksperimentelt projekt.
 
Organisation of TeachingDer benyttes i seks uger en kombination af teoretisk undervisning (forelæsning, 2 x 2 timer/uge) og opgaveregning/cases/laboratorieøvelser (2 x 3 timer/uge). I to uger laves et lidt større eksperimentelt projekt, hvortil der skrives en rapport.
 
Block PlacementBlok 2
Week Structure: A
 
Teaching LanguageDanish
 
Optional PrerequisitesAnbefalede forudsætninger: Biofysik eller Anvendt fysik samt cellebiologi
 
Areas of Competence the Course Will Address
Kompetencer indenfor grundvidenskab:
Forståelse for samenhængen mellem makromolekylers struktur og funktion.
Forståelse for det molekylære grundlag for protein-receptor/medicin-receptor vekselvirkning
Forståelse for det molekylære, fysiske grundlag for biomolekylers aggregering/selvassociering.

Kompetencer indenfor teknologi & produktion:
Forståelse af hvordan lysspredningsteknikker kan bruges til karakterisering af makromolekyler og deres vekselvirkninger.
Kan anvende metoderne i forbindelse med planlægning og udførelse af forsøg af bioteknologisk relevans.

Kompetencer indenfor etik & værdier:
-
 
Course Objectives
Målet er at give deltagerne en detaljeret forståelse af sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion på et fysisk grundlag. Herunder at give en forståelse for det molekylære grundlag for protein-receptor/medicin-receptor vekselvirkning. Målet er også at gøre deltagerne blive i stand til selvstændigt at udføre teoretiske og eksperimentelle undersøgelser over biomolekylers struktur.
 
Course Contents
Sekundær protein struktur og kooperativitet, multiple ligevægte for protein-protein og protein-hormon ligevægte. Allosterisk vekselvirkning. Mikroskopiske og makroskopiske bindingskonstanter.
Protein-receptor vekselvirkning og signal transduktion.
Betydning af ladning, dipolmoment, pH, ionstyrke og hydrophobicitet for struktur af proteiner, DNA og phospholipider.

Termodynamik for proteindenaturering.

Protein associering i forbindelse med amyloid og amyloid lignende aggregering. Modeller for kemiske reaktioner ved selvassociering/aggregering. Betydning af sekvensfejl for proteiners tendens til aggregering.

Der gives en grundig indføring i anvendelsen af lysspredningsteknikker til undersøgelse af strukturen af proteiner og andre makromolekyler samt deres indbydes vekselvirkninger.

Der udføres et mindre eksperimentelt projekt med lysspredning på udvalgte protein-aggregeringssystemer. Projektet afsluttes med en rapport.
 
Teaching And Learning Methods
De grundlæggende emner gennemgås ved forelæsninger. Ved de teoretiske øvelser regnes der opgaver. Laboratorie øvelserne vil blive brugt til at lave et projekt omkring amyloid lignende aggregering ved hjælp af kromatografi kombineret med lysspredning. Øvelserne afsluttes med mindre rapporter, som skal godkendes.
 
Course Litterature
Der søges efter egnet lærebogsmateriale.
 
Course Coordinator
Lars Holm Øgendal, lho@life.ku.dk, Department of Natural Sciences/Biophysics, Phone: 35332288
 
Study Board
Study Committee NSN
 
Course Scope
lectures24
theoretical exercises36
practicals16
project work24
preparation102
examination4

206