220004 Molekylær biofysik

Detaljer
Inst. for Grundvidenskab
Tidligst mulig placeringBachelor 2. år
VarighedEn blok
 
Pointværdi7.5 (ECTS)
KursustypeBachelorkursus
 
EksamenSluteksamen

skriftlig prøve


Skriftlig auditorieeksamen

Alle hjælpemidler tilladt

Beskrivelse af eksamen: 4 timers skriftlig eksamen. Der regnes opgaver bredt inden for kursets emner.

Vægtning: 100%



bestået/ikke bestået, intern censur

Eksamensdatoer:
28 January 2006
 
Forudsætninger for indstilling til eksamenAflevering af rapport over eksperimentelt projekt.
 
Rammer for undervisningDer benyttes i seks uger en kombination af teoretisk undervisning (forelæsning, 2 x 2 timer/uge) og opgaveregning/cases/laboratorieøvelser (2 x 3 timer/uge). I to uger laves et lidt større eksperimentelt projekt, hvortil der skrives en rapport.
 
BlokplaceringBlok 2
Ugestruktur: A
 
UndervisningssprogDansk
 
Anbefalede forudsætningerAnbefalede forudsætninger: Biofysik eller Anvendt fysik samt cellebiologi
 
Kompetenceområder
Kompetencer indenfor grundvidenskab:
Forståelse for samenhængen mellem makromolekylers struktur og funktion.
Forståelse for det molekylære grundlag for protein-receptor/medicin-receptor vekselvirkning
Forståelse for det molekylære, fysiske grundlag for biomolekylers aggregering/selvassociering.

Kompetencer indenfor teknologi & produktion:
Forståelse af hvordan lysspredningsteknikker kan bruges til karakterisering af makromolekyler og deres vekselvirkninger.
Kan anvende metoderne i forbindelse med planlægning og udførelse af forsøg af bioteknologisk relevans.

Kompetencer indenfor etik & værdier:
-
 
Kursets målsætning
Målet er at give deltagerne en detaljeret forståelse af sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion på et fysisk grundlag. Herunder at give en forståelse for det molekylære grundlag for protein-receptor/medicin-receptor vekselvirkning. Målet er også at gøre deltagerne blive i stand til selvstændigt at udføre teoretiske og eksperimentelle undersøgelser over biomolekylers struktur.
 
Kursusindhold
Sekundær protein struktur og kooperativitet, multiple ligevægte for protein-protein og protein-hormon ligevægte. Allosterisk vekselvirkning. Mikroskopiske og makroskopiske bindingskonstanter.
Protein-receptor vekselvirkning og signal transduktion.
Betydning af ladning, dipolmoment, pH, ionstyrke og hydrophobicitet for struktur af proteiner, DNA og phospholipider.

Termodynamik for proteindenaturering.

Protein associering i forbindelse med amyloid og amyloid lignende aggregering. Modeller for kemiske reaktioner ved selvassociering/aggregering. Betydning af sekvensfejl for proteiners tendens til aggregering.

Der gives en grundig indføring i anvendelsen af lysspredningsteknikker til undersøgelse af strukturen af proteiner og andre makromolekyler samt deres indbydes vekselvirkninger.

Der udføres et mindre eksperimentelt projekt med lysspredning på udvalgte protein-aggregeringssystemer. Projektet afsluttes med en rapport.
 
Undervisningsform
De grundlæggende emner gennemgås ved forelæsninger. Ved de teoretiske øvelser regnes der opgaver. Laboratorie øvelserne vil blive brugt til at lave et projekt omkring amyloid lignende aggregering ved hjælp af kromatografi kombineret med lysspredning. Øvelserne afsluttes med mindre rapporter, som skal godkendes.
 
Litteraturhenvisninger
Der søges efter egnet lærebogsmateriale.
 
Kursusansvarlig
Lars Holm Øgendal, lho@life.ku.dk, Institut for Grundvidenskab/Biofysik, Tlf: 35332288
 
Studienævn
Studienævn NSN
 
Kursusbeskrivelsesomfang
forelæsninger24
teoretiske øvelser36
praktiske øvelser16
projektarbejde24
forberedelse102
eksamen4

206