045161 Plant Genetic Mapping

Details
Department of Agricultural Sciences
Department of Ecology   0 %
Earliest Possible Year
Duration1 semester
 
Credits6 (ECTS)
Course LevelJoint BSc and MSc
Fælles for bachelor- og kandidatuddannelse
 
Examinationwritten examination


Aid allowed

Description of Examination: 13-point scale, internal examiner

Dates of Exam:
 
Organisation of TeachingKombination af forelæsning og øvelser: 1 skemamodul pr. uge
 
Block PlacementE4, efterår
Efter aftale

 
Teaching LanguageDanish
 
Optional Prerequisites055411 Plant Breeding
057518 Plant Biology
010611 Statistics, Basic Course
Planteforædling, Plantebiologi, Statistisk grundkursus.
 
Course Objectives
Kurset giver den studerende et grundlæggende kendskab til det tekniske og teoretiske grundlag for moderne beskrivelse af plantegenomers opbygning baseret på anvendelsen af molekylære markører og herigennem forudsætningen for effektiv anvendelse af disse nye teknikker indenfor planteforædling og bioteknologi.
 
Course Contents
Væsentligste forelæsningsemner:
- Genetiske markører: Fænotypiske, isoenzymer, RFLP, RAPDs, AFLP, mikrosatelliter, SNPs, analyseret med ekektroforese, chips og mikroarrays.
- Genetisk diversitet og beslægtethedsanalyse samt relateret software
- Genetisk kobling og konstruktion af koblingskort samt relateret software
- Opsplitning af kvantitative egenskaber i QTLs og relateret software (bestemmelse af dominans og vekselvirkninger for QTLs)
- Markørbaserede selektionssystemer (MAS)
Kurset skal udfylde de teoretiske og videnmæssige tomrum, der er opstået mellem den molekylære genetik og den mere anvendte plantegenetik som følge af fremkomsten af molekylære markørsystemer, som er ved at få afgørende betydning til planteforædlingsformål og til studier af planters genetiske diversitet.
 
Teaching And Learning Methods
Stoffet gennemgås ved en kombination af forelæsninger og teoretiske og praktiske øvelser.
 
Course Litterature
Phillips, R.L., Vasil, I.K. (1994): DNA-based markers in Plants. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, ISBN 0-7923-2714-4, 380 ppSasaki, T., More, G. (1997): Oryza: From Molecule to Plant. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, ISBN 0-7923-4455-3, 240 pp
 
Course Coordinator
Sven Bode Andersen, sba@life.ku.dk, Department of Agricultural Sciences/Plant and Soil Science, Phone: 35333444
Error. Person Not Found 
Henriette Giese, heg@life.ku.dk, Department of Ecology/Section of Genetics and Microbiology, Phone: 35332638
 
Study Board
Study Committee AHJ
 
Course Scope
lectures30
theoretical exercises15
practicals15
preparation75
examination25
Excursions20

180